Badanie fauny i flory pod kątem zanieczyszczeń i substancji chemicznych stanowi kluczowy element projektów oceny środowiskowej. Analizy te pomagają określić, w jaki sposób zanieczyszczenia gromadzą się w łańcuchu pokarmowym oraz ujawniają potencjalne efekty przenoszenia zanieczyszczeń między różnymi ekosystemami.
Jednym z najbardziej znanych przykładów są badania orłów, fok i ryb mające na celu ocenę poziomu PCB w Morzu Bałtyckim, a także analizy zwierząt transportowanych w celu potwierdzenia przenoszenia zanieczyszczeń do wcześniej nieskażonych obszarów.